3.kolo – 23.9.2009 – středa – 16:30
94 Karlovy Vary – SK Slavia Praha (8.10.2009 – čtvrtek – 16:00)
95 Třebíč – Znojmo
96 Písek – FK Baumit Jablonec
97 FK Viktoria Žižkov – SK D.České Budějovice
98 Varnsdorf – 1.FK Příbram
99 FK Dukla Praha – FC Viktoria Plzeň (22.9.2009 – úterý – 16:30)
100 FC Hradec Králové – Bohemians Praha
101 Slovan Liberec – FC Tescoma Zlín (22.9.2009 – úterý – 16:00)
102 Protivanov – SK Sigma Olomouc
103 Břeclav – SK Kladno
104 FC Hlučín – FK Teplice
105 SFC Opava – FC Baník Ostrava (16.9.2009 – středa – 18:00)
106 Sokol Živanice – FC Vítkovice (29.9.2009 – úterý – 16:30)
107 MFK OKD Karviná – 1.FC Brno (24.9.2009 – čtvrtek – 16:30)
108 FK Fotbal Třinec – Bohemians 1905
109 Náchod-Deštné – AC Sparta Praha (8.10.2009 – čtvrtek – 16:00)